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Neosuite MNPD 微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫
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最后更新:2014-03-04
關(guān) 注 度:2434
生產(chǎn)企業(yè):創(chuàng)騰科技有限公司
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產(chǎn)品詳細(xì)介紹 (NeoSuite Microbial Natural Products Database, NeoSuite )
      創(chuàng)騰科技有限公司和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院生物技術(shù)研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD是基于Symyx 公司的ISIS Base化學(xué)信息管理系統(tǒng)構(gòu)建的,在數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個(gè)已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗(yàn),數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了近幾十年來主要相關(guān)文獻(xiàn),專利及專著中的微生物代謝物共15000多個(gè),其中有確切化學(xué)結(jié)構(gòu)式的共10000多個(gè)。化合物的相關(guān)信息包括來源,制備,理化性質(zhì),化學(xué)結(jié)構(gòu),生物活性以及原始文獻(xiàn)等數(shù)據(jù)。MNPD可以為從事藥物化學(xué),微生物學(xué),生物化學(xué),藥理學(xué),新藥篩選,天然產(chǎn)物研發(fā),組合化學(xué),化學(xué)信息學(xué)等領(lǐng)域的科研人員提供極大的幫助,如天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)檢索,虛擬藥物篩選,構(gòu)效關(guān)系研究,作為組合化學(xué)的初始結(jié)構(gòu)等。
1、簡(jiǎn)介
     微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(Microbial Natural Products Database,MNPD)是創(chuàng)騰科技有限公司和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD是基于MDL公司的ISIS Base化學(xué)信息管理系統(tǒng)構(gòu)建的,在數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個(gè)已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗(yàn),數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了微生物天然產(chǎn)物的來源、制備、理化性質(zhì)、化學(xué)結(jié)構(gòu)、生物活性以及原始文獻(xiàn)等各方面信息,形成了數(shù)據(jù)全面、可滿足多種功能需求的綜合性的化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫。

2、數(shù)據(jù)庫特性
     首先,占全球80%市場(chǎng)份額的MDL ISIS化學(xué)信息管理系統(tǒng)擁有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),能夠方便的建立、管理和檢索化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫,并且可以利用通用接口十分方便的與其他系統(tǒng)如Accelrys和Tripos公司提供的分子模擬及分子設(shè)計(jì)軟件配合使用。使用者無需計(jì)算機(jī)專業(yè)知識(shí),只需進(jìn)行簡(jiǎn)單培訓(xùn)即可對(duì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索、瀏覽和維護(hù)。另外,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),迄今已從各種微生物發(fā)酵產(chǎn)物中分離得到20000多種代謝產(chǎn)物純品,其中具有生物活性的代謝產(chǎn)物達(dá)16000多種。而MNPD收集了近幾十年來主要相關(guān)專業(yè)文獻(xiàn)、專利及專著中的微生物代謝產(chǎn)物共15000多個(gè),其中有確切化學(xué)結(jié)構(gòu)式的共10000多個(gè)。這些多樣性的結(jié)構(gòu)完全覆蓋了附表中所列出的所有微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物的類別。

3、數(shù)據(jù)庫內(nèi)容
MNPD收集的信息包括以下各個(gè)方面的內(nèi)容:
• 基本信息:微生物天然產(chǎn)物的俗名、別名、IUPAC命名、分子式、分子量、化合類型、CAS登記號(hào)等
• 物化性質(zhì)和譜圖信息:微生物天然產(chǎn)物的顏色、晶型、熔點(diǎn)、旋光度、溶解性、紫外和紅外特征吸收峰等
• 結(jié)構(gòu)信息:已確定的微生物天然產(chǎn)物的二維分子結(jié)構(gòu)式及利用分子力學(xué)方法優(yōu)化得到的三維分子結(jié)構(gòu)
• 來源和生物活性:微生物產(chǎn)物的產(chǎn)生菌、制備方法及生物活性測(cè)試結(jié)果
• 原始參考文獻(xiàn)及專利信息
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